このゲームではルールブックに載っている基本ルール、オプションルール、上級ルールを使用しています。ただし、オプションルールの「長時間ゲーム」は使用していません。上級ルールには、基本ルール＋オプションルールに加えて、以下の３つのルールが追加されます。
１．各ターンのスパイス発生ラウンドで、スパイスが発生するテリトリーは１つではなく２つになります２．戦闘において、戦闘ユニットは単独では基本ルールの半分の戦闘力しか持ちません。プレイヤーは戦闘に使用する戦闘ユニット１つにつき１スパイスを消費することで、完全戦力を持たせることができます。
| 通常ユニット | サルダウカーあるいはフェダイキン | |
| スパイス消費なし | ０．５戦闘力 | １戦闘力 |
| １スパイス消費 | １戦闘力 | ２戦闘力 |
３．各ターンのスパイス収穫ラウンドで、以下の要塞を支配しているプレイヤーはそれぞれ以下のスパイスを受け取ります。受け取るスパイス数は配置している戦闘ユニット数に関わらず一定です。
| 要塞 | スパイス数 |
| Arrakeen | ２スパイス |
| Carthag | ２スパイス |
| Tuek's Sietch | １スパイス |
また、このゲームでは以下のローカルルールを使用しています。
１．３人以上のプレイヤーが１つの同盟を締結することはできません。このゲームはメールを介して行われているため、会話は必ずしも全員に聞こえるわけではありません。そのため、同盟している、していないに関わらず、密談や密約を行って良い、とされています。秘密裏に約束事をかわした場合、それはルール上の拘束力を持ちませんが、約束事をかわした事実が他プレイヤーに知られることもありません。スパイスの受け渡しも秘密裏に行われます。２．同盟を結んだプレイヤーは勝利条件として２人で４つの要塞を支配しなければなりません。
３．戦闘に先立ち、プレイヤーはリーダーを使用しないで戦闘を行って良いか相手プレイヤーに訊ねることができます。相手が了承した場合に限り、リーダーを使用しないで戦闘を行うことができます（当然、兵器カード、防御カードも使用できません）。
４．オプションルールでは、ベネ・ゲセリットの同伴能力は、他プレイヤーが輸送したテリトリーにしか同伴できませんが、このゲームではベネ・ゲセリットプレイヤーが望むならPolar Sinkに降下することもできます。
※各プレイヤーのスパイスを計算しながらこのゲームを追っていくと、明らかに支払えない額のスパイスを支払っていることがあります。これは、そのプレイヤーが密約により密かにスパイスを受け取ったということです。そのほか、細かいルール上の差異があるかもしませんがご了承下さい。